摘要：通过对美国华盛顿洲在3～4月底爆发的新冠肺炎病人二代高通量测序数据分析，找出新冠病毒刺突糖蛋白(简称S朊)中存在的所有突变类型，为研究病毒在体内复制的突变规律及研究疫苗提供基础资料。方法:利用NCBI中公布的130例美国华盛顿区报道的新冠肺炎病人二代高通量测序数据，进行序列组装，并对其朊编码基因进行深度突变分析，找出其潜在的疑似抗原变异位点(antigen variation，以下简称突变点)。结果:排除30条未获全长的数据，共获得100份病人完整的SARS-CoV-2序列，其S朊编码基因，主要突变点集中在S1区的SP区，及受体结合区(RBD)之前的间隔区(突变区基本呈连续分布:126aa～153aa,194aa～204aa); S2区的1250aa～1270aa区。结论:100份样本的数据研究结果显示，新冠病毒S基因在病人体内复制过程中较为稳定，编码氨基酸的突变点(突变频率> 15%)呈单样本散在分布，且S2区较S1区更为稳定。未在新冠病毒的RBD区找到突变率> 20%的点，而S区散在零星突变区域主要集中在S1区间隔区(126aa～153aa,194aa～204aa处，且基本呈连续分布)和S2末端约20aa处。

发表日期：2020-09-10

期刊分区（SCI为中科院分区）：无

收录情况：CSCD（中国科技引文期刊）（扩展）

发表期刊名称：微生物学杂志

参与作者：李爽,金德才

通讯作者：徐朋朋

第一作者：万云洋

论文类型：期刊论文

论文概要：徐朋朋,李爽,金德才,万云洋，基于二代高通量测序技术的新型冠状肺炎病毒S朊突变点分析，微生物学杂志，2020，

论文题目：基于二代高通量测序技术的新型冠状肺炎病毒S朊突变点分析